Wenn du "double buffering" aktivierst sollte sich der Effekt abschwächen oder gar ganz verschwinden.

Schreib dazu folgenden Code in Init-Routine fürs Formular.

this.SetStyle(ControlStyles.DoubleBuffer | ControlStyles.UserPaint | ControlStyles.AllPaintingInWmPaint, true);
this.UpdateStyles();

Edit:
Eine mögliche Lösung für dein Problem das der Designer nicht mehr mitspielt wäre die zwei Zeilen vom Compiler nur im Release-Modus zu aktivieren. Zwar würde es dann im Debug-Modus weiter "Laggen" aber im Release-Build wäre das Problem dann weg.
Umsetzten kannst du das mit den Compiler-Anweisungen und Compiler-Konstanten.

Ein Beispiel:

public void Form1(){

  InitializeComponent();
  ...
  #if !DEBUG
  this.SetStyle(ControlStyles.DoubleBuffer | ControlStyles.UserPaint | ControlStyles.AllPaintingInWmPaint, true);
  this.UpdateStyles();
  #end if
  ...
}

in VB.Net:

public sub New()

  InitializeComponent()
  ...
  #if not DEBUG then
  me.SetStyle(ControlStyles.DoubleBuffer | ControlStyles.UserPaint | ControlStyles.AllPaintingInWmPaint, true)
  me.UpdateStyles()
  #end if
  ...
end sub

Falls du die SetStyle-Anweisung in die InitializeComponent-Methode geschrieben hast, könnte das auch das Problem sein. Im Construktor nach dem Aufruf von "InitializeComponent" ist diese besser aufgehoben.