Bin bislang nur über Unity gestolpert.

Lightcore ist meine Empfehlung.

Ich kenn noch Windsor vom CastleProject. Hab ich aber persönlich noch nie verwendet.

Gruß
Florian

Es lohnt sich auch MEF (Microsoft Extensable Framework) anzusehen. Obwohl man nicht sagen kann, dass es ein kompletter IoC-Container ist. Kommt darauf an, was man gerne erreichen möchte.
Hier ein Link zu einer kurzen Beschreibung: Application Extensibility: MEF vs. IoC

Castle.Windsor (http://docs.castleproject.org/Windsor.MainPage.ashx) ist sicherlich noch einen Blick wert.

LightCore ist auch mein Favorit. Einfach und praktisch :)

NInject passt gut zu MVC und ist für die einfachen Fälle eine gute Wahl.

codekicker benutzt Unity. Es ist leicht zu benutzen und erweiterbar. Z.b. haben wir die eingebauten LifetimeManager erweitert um einen pro-thread LifetimeManager, damit wir Unity auf einen background thread nutzen können. Normalerweise laufen ja alle unity-zugriffe in einer Webanwendung pro HTTP-Request ab. Ein Hintergrundthread hat aber keinen HTTP-Context. Die Erweiterung war sehr leicht zu machen. Auch alles andere war nicht schwer mit Unity.

Autofac

Integration in WCF und MVC möglich, bietet verschiede Lifetime Scopes an, schnell, sauber, perfekt!

Edit:
Hier und hier werden die verschiedenen Frameworks verglichen.